Sejumlah agenda strategis yang menjadi kerangka dalam penyusunan program adalah:  

1. Memperkuat peran lembaga swadaya masyarakat (LSM) yang concern terhadap persoalan sosial-keagamaan, khususnya yang  memiliki hubungan kultural dengan Muhammadiyah. Eksistensi lembaga-lembaga ‘skoci’ ini dapat mempengaruhi cara pandang dan kebijakan ormas Islam tersebut di masing-masing di tingkatan, termasuk dengan membangun program kemitraan dengan Angkatan Muda Muhammadiyah (AMM) dan lembaga/majlis di lingkungan Muhammadiyah sehingga perubahan dalam jangka panjang dapat dicapai.